Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl4P58321 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms