Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp25P57080 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp25P57080 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp25P57080 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp25P57080 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp25P57080 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp25P57080 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp25P57080 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms