Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmoP56726 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmoP56726 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmoP56726 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmoP56726 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmoP56726 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmoP56726 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmoP56726 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmoP56726 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmoP56726 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmoP56726 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmoP56726 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmoP56726 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmoP56726 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmoP56726 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmoP56726 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmoP56726 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmoP56726 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmoP56726 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmoP56726 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmoP56726 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmoP56726 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmoP56726 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmoP56726 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmoP56726 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmoP56726 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmoP56726 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SmoP56726 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SmoP56726 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmoP56726 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmoP56726 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmoP56726 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmoP56726 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmoP56726 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SmoP56726 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmoP56726 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmoP56726 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmoP56726 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SmoP56726 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SmoP56726 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SmoP56726 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmoP56726 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmoP56726 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmoP56726 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmoP56726 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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