Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c39P56656 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c39P56656 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c39P56656 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms