Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pex2P55098 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pex2P55098 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pex2P55098 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pex2P55098 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pex2P55098 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pex2P55098 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms