Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn1P54254 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atxn1P54254 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn1P54254 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms