Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtbP53612 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RabggtbP53612 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RabggtbP53612 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms