Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efnb1P52795 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efnb1P52795 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efnb1P52795 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efnb1P52795 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efnb1P52795 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms