Protein–RNA interactions for Protein: P52792

Gck, Glucokinase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GckP52792 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GckP52792 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GckP52792 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GckP52792 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GckP52792 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GckP52792 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GckP52792 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GckP52792 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GckP52792 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GckP52792 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GckP52792 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GckP52792 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GckP52792 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GckP52792 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GckP52792 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GckP52792 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GckP52792 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GckP52792 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GckP52792 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GckP52792 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GckP52792 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GckP52792 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GckP52792 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GckP52792 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GckP52792 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GckP52792 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GckP52792 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GckP52792 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GckP52792 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GckP52792 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GckP52792 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms