Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr5P51682 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr5P51682 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr5P51682 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr5P51682 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms