Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RoraP51448 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RoraP51448 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RoraP51448 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RoraP51448 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RoraP51448 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RoraP51448 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RoraP51448 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RoraP51448 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RoraP51448 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RoraP51448 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RoraP51448 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RoraP51448 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RoraP51448 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RoraP51448 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RoraP51448 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RoraP51448 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RoraP51448 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RoraP51448 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RoraP51448 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RoraP51448 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RoraP51448 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RoraP51448 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms