Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CastP51125 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CastP51125 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CastP51125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CastP51125 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CastP51125 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CastP51125 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CastP51125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CastP51125 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CastP51125 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CastP51125 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CastP51125 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CastP51125 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CastP51125 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CastP51125 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CastP51125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CastP51125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CastP51125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CastP51125 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CastP51125 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CastP51125 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CastP51125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CastP51125 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CastP51125 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CastP51125 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CastP51125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CastP51125 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CastP51125 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CastP51125 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CastP51125 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CastP51125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CastP51125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CastP51125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CastP51125 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CastP51125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CastP51125 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CastP51125 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CastP51125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CastP51125 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CastP51125 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CastP51125 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CastP51125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CastP51125 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CastP51125 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CastP51125 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CastP51125 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CastP51125 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CastP51125 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CastP51125 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CastP51125 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CastP51125 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CastP51125 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CastP51125 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CastP51125 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CastP51125 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CastP51125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CastP51125 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CastP51125 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CastP51125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CastP51125 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CastP51125 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CastP51125 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CastP51125 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CastP51125 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CastP51125 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CastP51125 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CastP51125 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms