Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa10P50708 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa10P50708 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa10P50708 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa10P50708 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa10P50708 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms