Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SftpdP50404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SftpdP50404 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpdP50404 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 937.7 ms