Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VegfbP49766 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VegfbP49766 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VegfbP49766 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VegfbP49766 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VegfbP49766 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VegfbP49766 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VegfbP49766 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VegfbP49766 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VegfbP49766 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VegfbP49766 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VegfbP49766 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VegfbP49766 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VegfbP49766 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms