Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcls1P49710 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcls1P49710 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hcls1P49710 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hcls1P49710 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hcls1P49710 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hcls1P49710 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hcls1P49710 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hcls1P49710 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcls1P49710 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcls1P49710 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcls1P49710 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hcls1P49710 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hcls1P49710 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcls1P49710 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcls1P49710 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcls1P49710 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms