Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpreP49446 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpreP49446 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpreP49446 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpreP49446 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpreP49446 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpreP49446 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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