Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox8bP48772 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox8bP48772 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms