Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx3P48759 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms