Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Edn3P48299 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Edn3P48299 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Edn3P48299 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Edn3P48299 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn3P48299 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn3P48299 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn3P48299 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edn3P48299 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn3P48299 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn3P48299 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn3P48299 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edn3P48299 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms