Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl5P47962 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms