Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr7P47774 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr7P47774 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms