Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pax7P47239 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax7P47239 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms