Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsfP46460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms