Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad52P43352 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad52P43352 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad52P43352 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad52P43352 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad52P43352 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms