Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf7P43029 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf7P43029 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gdf7P43029 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms