Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HttP42859 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HttP42859 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HttP42859 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HttP42859 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HttP42859 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HttP42859 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HttP42859 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HttP42859 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HttP42859 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HttP42859 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HttP42859 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HttP42859 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HttP42859 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HttP42859 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HttP42859 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HttP42859 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HttP42859 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HttP42859 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HttP42859 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HttP42859 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HttP42859 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HttP42859 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HttP42859 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HttP42859 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HttP42859 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HttP42859 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HttP42859 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HttP42859 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HttP42859 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HttP42859 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HttP42859 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HttP42859 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HttP42859 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HttP42859 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HttP42859 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HttP42859 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HttP42859 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HttP42859 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HttP42859 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HttP42859 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HttP42859 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HttP42859 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HttP42859 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HttP42859 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HttP42859 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HttP42859 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HttP42859 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HttP42859 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HttP42859 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HttP42859 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HttP42859 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HttP42859 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HttP42859 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HttP42859 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HttP42859 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HttP42859 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HttP42859 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HttP42859 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HttP42859 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HttP42859 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms