Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-2P42580 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-2P42580 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx1-2P42580 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216 ms