Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk3P41971 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk3P41971 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk3P41971 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk3P41971 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms