Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf2P39429 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf2P39429 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf2P39429 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf2P39429 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf2P39429 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf2P39429 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf2P39429 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf2P39429 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf2P39429 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf2P39429 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms