Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf1P39428 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf1P39428 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf1P39428 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf1P39428 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf1P39428 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf1P39428 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf1P39428 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf1P39428 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf1P39428 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf1P39428 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms