Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik2P39087 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik2P39087 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik2P39087 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik2P39087 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik2P39087 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik2P39087 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik2P39087 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik2P39087 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik2P39087 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms