Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddit3P35639 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddit3P35639 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms