Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Grin2aP35436 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Grin2aP35436 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Grin2aP35436 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Grin2aP35436 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Grin2aP35436 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms