Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab21P35282 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab21P35282 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab21P35282 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab21P35282 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab21P35282 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab21P35282 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rab21P35282 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab21P35282 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab21P35282 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab21P35282 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab21P35282 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab21P35282 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab21P35282 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab21P35282 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab21P35282 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab21P35282 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab21P35282 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab21P35282 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.4 ms