Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp4P35123 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp4P35123 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp4P35123 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp4P35123 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms