Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifnar1P33896 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnar1P33896 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1820.9 ms