Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola2P33611 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola2P33611 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola2P33611 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pola2P33611 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola2P33611 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola2P33611 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pola2P33611 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola2P33611 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola2P33611 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola2P33611 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms