Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh15P33146 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1296.9 ms