Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AregP31955 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AregP31955 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AregP31955 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AregP31955 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AregP31955 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AregP31955 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AregP31955 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AregP31955 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AregP31955 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AregP31955 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AregP31955 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AregP31955 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AregP31955 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AregP31955 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AregP31955 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AregP31955 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AregP31955 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AregP31955 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AregP31955 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AregP31955 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AregP31955 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AregP31955 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AregP31955 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AregP31955 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AregP31955 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AregP31955 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AregP31955 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AregP31955 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms