Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfbP31240 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfbP31240 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfbP31240 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfbP31240 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms