Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd28P31041 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd28P31041 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd28P31041 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms