Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccnd3P30282 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd3P30282 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnd3P30282 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms