Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vcam1P29533 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcam1P29533 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vcam1P29533 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms