Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HexaP29416 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HexaP29416 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HexaP29416 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HexaP29416 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HexaP29416 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HexaP29416 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HexaP29416 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HexaP29416 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HexaP29416 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HexaP29416 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HexaP29416 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HexaP29416 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HexaP29416 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HexaP29416 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HexaP29416 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HexaP29416 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HexaP29416 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HexaP29416 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HexaP29416 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HexaP29416 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HexaP29416 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HexaP29416 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HexaP29416 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HexaP29416 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HexaP29416 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HexaP29416 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HexaP29416 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HexaP29416 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HexaP29416 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HexaP29416 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HexaP29416 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HexaP29416 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HexaP29416 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HexaP29416 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HexaP29416 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HexaP29416 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HexaP29416 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HexaP29416 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HexaP29416 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms