Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1P29341 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms