Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn10P28658 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn10P28658 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn10P28658 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms