Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa5P28312 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa5P28312 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa5P28312 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa5P28312 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms