Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa3P28310 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa3P28310 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa3P28310 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms