Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja4P28235 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gja4P28235 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja4P28235 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja4P28235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja4P28235 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja4P28235 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms